Sur les Îles principales de Mahé et de Praslin, les déplacements en bus sont facilités car les arrêts d'autobus sont présents sur tous les itinéraires. Sur Mahé le dépôt central d'autobus se trouve à Victoria, et fonctionne de 05h30 à 22H00, bien que le service soit moins fréquent après 18H30. Pour connaÎtre les horaires de passage des bus, vous pouvez consulter un programme détaillé au dépôt d'autobus.
Des taxis indépendants sont disponibles sur Mahé et Praslin, et une poignée le sont sur La Digue. Vous pouvez les héler dans la rue, les prendre aux stations de taxis ou encore téléphoner directement au chauffeur. Il est recommandé de demander le coût préalable de la course si le taxi n'est pas équipé de compteur. Beaucoup de taxis prendront des clients en visites guidées pour un tarif d'ensemble, à négocier avant la course.
Vous ne trouverez des véhicules à la location que sur Mahé et Praslin avec plusieurs compagnies représentées à l'aéroport international de Mahé et dans les plus grands hôtels. La location de votre véhicule peut également se faire via votre réceptif qui pourra vous réserver le véhicule de votre choix, parmi une large gamme proposée incluant des Mini-mokes, des berlines, des 4 roues motrices, des fourgonnettes ou même des Mercedes avec chauffeur. Un permis de conduire européen ou international en cours de validité est exigé pour toute location de véhicules et la plupart des compagnies vous proposeront un service de livraison et de récupération du véhicule à l’endroit de votre choix. A noter que les véhicules se conduisent à gauche.
Pour optimiser la découverte des Îles, un service de guides touristiques est à pied d’œuvre pour vous initier aux nombreux itinéraires de marche ou de randonnée ainsi que les sites les plus intéressants, que vous choisissiez de les explorer à pied ou à bord d’un véhicule confortable.
Vous pouvez également découvrir les Îles en bicyclette, que vous pourrez facilement louer sur La Digue et sur Praslin, où elles sont largement utilisées comme mode de transport.
Le transfert d’Île est possible grâce au développement d’un réseau de transport aérien et maritime régulier, à partir de l'Île principale, Mahé.
Air Seychelles propose un service de navette entre Mahé et Praslin, la deuxième plus grande Île des Seychelles. Le vol dure seulement 15 minutes avec une moyenne de 20 vols aller/retour journaliers. Air Seychelles a également instauré des vols inter Îles, habituellement sur demande des hôtels vers Bird island, Denis Island, Desroches Island et Alphonse.
Parmi les compagnies aériennes figurent également Helicopter Seychelles et Zil Air, deux compagnies de vols charter par hélicoptère spécialisées dans les transferts entre les îles, les excursions et les vols charter panoramiques dans l’ensemble des Seychelles. L’Islands Development Company (IDC) propose quant à elle essentiellement des vols charter à destination des Îles Extérieures des Seychelles.
Les ferries traditionnels, de type goélette pouvant être manœuvrée à la voile, effectuent la navette entre la jetée de la Baie Ste. Anne à Praslin et la jetée de La Passe à La Digue.
Pour un mode de traversée plus moderne, vous pouvez choisir le Cat Cocos, qui opère entre le quai inter-îles de Victoria et la jetée de la Baie Ste. Anne à Praslin (trajet de moins d’1 heure), ou le catamaran Kat Roses, qui effectue principalement la liaison entre la jetée de la Baie Ste. Anne à Praslin et la jetée de La Passe à La Digue.